定制网站建设虽能满足特定需求，但并非毫无缺点。首先，成本是一大问题。定制网站建设需投入大量资金，从设计、开发到测试，每一个环节都需要专业人员参与，人力成本颇高。而且，后期的服务器维护、软件更新等也会持续产生费用，这对于预算有限的企业或个人来说，可能是难以承受的负担。

技术方面的要求也较为复杂。定制网站需要专业的技术团队来操作，若企业自身缺乏相关技术人才，在建设过程中就可能面临诸多困难。比如与开发团队沟通不畅，导致最终呈现的网站与预期不符，或者在技术实现上出现漏洞，影响网站的稳定性和安全性。

维护也是定制网站建设的一个痛点。由于是定制开发，网站的架构和代码可能比较独特，这使得后续的维护工作难度加大。一旦出现问题，寻找熟悉该网站架构的技术人员进行修复可能比较耗时，甚至可能找不到合适的人来解决。而且，随着技术的不断发展和更新，定制网站可能需要频繁进行升级和优化，以适应新的需求和安全标准，这无疑增加了维护的工作量和成本。

此外，定制网站建设的周期通常较长。从需求沟通、设计方案确定到最终开发完成，可能需要数月时间。这期间市场情况可能发生变化，企业的需求也可能有所调整，而定制网站的灵活性相对较差，难以快速响应这些变化。如果在网站建设过程中出现需求变更，往往需要重新投入大量的时间和精力进行修改，进一步延长了项目周期。

定制网站建设还存在兼容性问题。不同的设备、浏览器和操作系统对网站的显示和功能支持可能有所不同。为了确保网站在各种环境下都能正常运行，需要进行大量的测试和优化工作。但即便如此，也很难做到在所有设备和浏览器上都完美兼容，这可能会影响用户体验。

综上所述，定制网站建设虽然有其独特优势，但缺点也不容忽视。在决定进行定制网站建设时，企业或个人需要充分考虑自身的预算、技术实力、维护能力以及对网站的长期规划等因素，权衡利弊后再做决策。